{"id":13189,"date":"2023-07-31T10:22:27","date_gmt":"2023-07-31T09:22:27","guid":{"rendered":"https:\/\/telecomkh.info\/?p=13189"},"modified":"2023-07-31T10:22:27","modified_gmt":"2023-07-31T09:22:27","slug":"optimizacion-del-proceso-de-ensamblaje-genomico-basado-en-tecnologias-cuanticas-y-comparativa-con-aproximaciones-clasicas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/telecomkh.info\/?p=13189","title":{"rendered":"Optimizaci\u00f3n del proceso de ensamblaje gen\u00f3mico basado en tecnolog\u00edas cu\u00e1nticas y comparativa con aproximaciones cl\u00e1sicas"},"content":{"rendered":"

Supone una primera experiencia de las industrias de Salud y LifeSciences en la aplicaci\u00f3n de tecnolog\u00edas cu\u00e1nticas en el \u00e1mbito de la gen\u00f3mica, centrado en comparar la optimizaci\u00f3n del proceso de ensamblaje gen\u00f3mico, utilizando aproximaciones cl\u00e1sicas y cu\u00e1nticas<\/strong><\/p>\n

NTT DATA ha anunciado la finalizaci\u00f3n del proyecto de optimizaci\u00f3n del proceso de ensamblaje gen\u00f3mico a partir de la utilizaci\u00f3n de tecnolog\u00edas cu\u00e1nticas, y que supone un primer hito en la utilizaci\u00f3n de este tipo de tecnolog\u00edas en las industrias de Salud y LifeSciences.
\nEste proyecto, consiste en explorar la capacidad y viabilidad de utilizar la Computaci\u00f3n Cu\u00e1ntica para el ensamblaje gen\u00f3mico mediante la comparaci\u00f3n de enfoques de computaci\u00f3n cu\u00e1ntica y no cu\u00e1ntica, al mismo tiempo que abordamos un problema de ensamblaje gen\u00f3mico utilizando un entorno simulado inspirado en el mundo real. Mediante la secuenciaci\u00f3n y el ensamblaje de los genomas de individuos, los cient\u00edficos pueden identificar variaciones gen\u00e9ticas asociadas con ciertas enfermedades o condiciones. Esta informaci\u00f3n puede utilizarse para desarrollar nuevos tratamientos o terapias que se centren en las causas gen\u00e9ticas subyacentes de las enfermedades.
\nEn esta colaboraci\u00f3n entre NTT DATA Spain, NTT DATA Brazil y el Centro de Innovaci\u00f3n Cu\u00e1ntica de NTT DATA, el objetivo ha consistido en implementar y comparar algoritmos de computaci\u00f3n cl\u00e1sicos \u2013 no cu\u00e1nticos \u2013 y algoritmos cu\u00e1nticos en base a dos aproximaciones.
\nEn la aproximaci\u00f3n cl\u00e1sica se ha usado el producto Gurobi \u2013 uno de los paquetes para problemas de optimizaci\u00f3n combinatoria m\u00e1s potentes \u2013 y el algoritmo Simulated Annealing. En la aproximaci\u00f3n cu\u00e1ntica se ha usado la tecnolog\u00eda Quantum Annealing con qubits superconductores de la compa\u00f1\u00eda D-Wave. Tambi\u00e9n se ha simulado la tecnolog\u00eda CIM – del ingl\u00e9s Coherent Ising Machine – de NTT Research. La comparativa, se ha realizado a partir de la medici\u00f3n de indicadores de eficiencia computacional, precisi\u00f3n, y escalabilidad.
\nPara llevar a cabo la prueba de concepto y la comparativa se ha utilizado el mismo set de datos como referencia. Espec\u00edficamente, se ha generado sint\u00e9ticamente la secuenciaci\u00f3n del genoma del bacteri\u00f3fago phiX174 lo cual ha permitido simular distintos escenarios de prueba y comparaci\u00f3n de los indicadores de referencia.
\nSi bien los resultados derivados de la prueba de concepto muestran que los enfoques puramente cu\u00e1nticos presentan todav\u00eda dificultades para abordar problemas grandes, en el momento en que la capacidad de computaci\u00f3n aumente se podr\u00e1 constatar una mejora sustancial en el tiempo de proceso seg\u00fan el tama\u00f1o el problema que pasa de ser exponencial en sistemas tradicionales a casi lineal en sistemas cu\u00e1nticos. Un enfoque h\u00edbrido, cl\u00e1sico-cu\u00e1ntico, con tecnolog\u00eda como la de D-Wave, puede competir con t\u00e9cnicas tradicionales como Gurobi, ya que es capaz de encontrar soluciones \u00f3ptimas para todos los escenarios planteados, incluidos los de mayor tama\u00f1o. Estos resultados son muy prometedores y sugieren que la computaci\u00f3n cu\u00e1ntica puede ser una alternativa viable a los m\u00e9todos cl\u00e1sicos para resolver problemas de optimizaci\u00f3n de gran tama\u00f1o en biolog\u00eda, salud y otras \u00e1reas
\nDavid Montal \u2013 Head of Pharma & Life Sciences – y Jose Aznar, l\u00edder del proyecto y responsable de Innovaci\u00f3n en Salud de NTT DATA EMEAL han explicado que \u00abEsta prueba de concepto supone una primera experiencia en la utilizaci\u00f3n de tecnolog\u00edas cu\u00e1nticas en el \u00e1mbito de la Salud. Si bien el grado de madurez de las tecnolog\u00edas cu\u00e1nticas es todav\u00eda incipiente, su aplicabilidad en el medio y largo plazo ser\u00e1 determinante en aplicaciones de \u00e1mbitos tales como la gen\u00f3mica, el procesado de imagen digital y a anal\u00edtica de datos de salud en tiempo real donde la eficiencia y capacidad de procesado sean claves\u201d.<\/p>\n

Arriba, Imagen cortes\u00eda de NTT Data<\/em><\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Supone una primera experiencia de las industrias de Salud y LifeSciences en la aplicaci\u00f3n de tecnolog\u00edas cu\u00e1nticas en el \u00e1mbito de la gen\u00f3mica, centrado en comparar la optimizaci\u00f3n del proceso de ensamblaje gen\u00f3mico, utilizando aproximaciones cl\u00e1sicas y cu\u00e1nticas NTT DATA ha anunciado la finalizaci\u00f3n del proyecto de optimizaci\u00f3n del proceso de ensamblaje gen\u00f3mico a partir … <\/p>\n

Continue reading \u00abOptimizaci\u00f3n del proceso de ensamblaje gen\u00f3mico basado en tecnolog\u00edas cu\u00e1nticas y comparativa con aproximaciones cl\u00e1sicas\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":13190,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[69],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/13189"}],"collection":[{"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=13189"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/13189\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":13191,"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/13189\/revisions\/13191"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/13190"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=13189"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=13189"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/telecomkh.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=13189"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}